一般来说，商务合同纠纷应由合同签订地或被告住所地的基层法院管辖。随后，法院将组织开庭审理，各方提供证据并进行辩论。当事人可以根据判决结果申请执行或者提起上诉。
商务合同纠纷起诉法院的具体步骤如下：
1. 查明管辖法院：首先需要确认该纠纷应由哪个法院管辖。一般来说，商务合同纠纷应由合同签订地或被告住所地的基层法院管辖。如果合同中约定了争议解决方式（如仲裁），则按照约定选择相应的仲裁机构。
2. 准备诉讼材料：准备起诉所需的材料，包括起诉状、证据文件、合同、凭证等，并确保材料齐全、合法、有效。
3. 缴纳诉讼费用：依据当地法院规定，缴纳相应的诉讼费用。如果经济困难无法缴纳，可以申请贫困证明并提出免除或减免诉讼费的申请。
4. 提起诉讼：将准备好的起诉材料提交给管辖法院，递交起诉状并办理诉讼登记手续。
5. 受理与审理：法院收到起诉材料后，会进行立案受理，并通知对方进行答辩。随后，法院将组织开庭审理，各方提供证据并进行辩论。
6. 审判结果：法院依法判断并作出判决或裁定。当事人可以根据判决结果申请执行或者提起上诉。
需要注意的是，起诉过程中可以委托律师代理，律师会根据具体情况提供专业的法律咨询和代理服务。以上所述只是一般流程，具体操作应根据当地法律规定以及法院的具体要求来进行。建议在起诉前咨询专业律师。